У наших клеток есть собственная память. Как тело усваивает информацию в обход нервной системы

Пост опубликован в блогах iXBT.com, его автор не имеет отношения к редакции iXBT.com
| Статья | Наука и космос

В когнитивной психологии и нейробиологии существует базовое правило, известное как эффект интервального повторения. Суть его сводится к тому, что любая информация усваивается и сохраняется значительно лучше, если она поступает отдельными порциями с временными перерывами, а не единым непрерывным потоком. Этот феномен был впервые задокументирован Германом Эббингаузом еще в конце XIX века при изучении кривой забывания.

На протяжении многих десятилетий наука исходила из предпосылки, что способность обрабатывать временные паттерны и конвертировать их в долговременную память является эксклюзивным свойством нервной системы. Считалось, что этот процесс напрямую и неразрывно связан со сложной архитектурой нейронов, формированием синапсов и передачей электрических импульсов.

Память клетки, вольная интерпретация
Автор: ИИ Copilot Designer//DALL·E 3 Источник: www.bing.com

Однако новое исследование группы биологов из Нью-Йоркского университета, результаты которого опубликованы в журнале Nature Communications, меняет наше понимание когнитивных процессов. Ученые доказали, что молекулярные механизмы, отвечающие за формирование памяти, не требуют наличия нейронных сетей. Способность фиксировать ритм поступающих сигналов и реагировать на интервалы встроена в базовую биохимическую структуру практически любой человеческой клетки, включая те, которые не имеют никакого отношения к нервной системе.

Молекулярная архитектура воспоминаний

Сначала лучше рассмотреть формирование памяти не на уровне анатомии мозга, а на уровне внутриклеточной химии. Запоминание информации — это не просто циркуляция электрического заряда. Это процесс изменения физической структуры клетки, который происходит в ее ядре.

Когда нейрон получает серию специфических сигналов извне, внутри него запускается строгая последовательность химических реакций. Ключевую роль в этом каскаде играют ферменты, называемые протеинкиназами (в частности, PKA и PKC). Они активируют другой важный белок — ERK, который после активации перемещается в клеточное ядро. Там он воздействует на фактор транскрипции CREB.

Белок CREB выступает в роли главного интегратора клеточного опыта. Его задача — запустить экспрессию определенных генов, которые начинают синтезировать новые белки. Именно эти новые белки модифицируют функции клетки на длительное время, превращая кратковременный сигнал в долговременное структурное изменение. Так формируется физический носитель памяти.

Исследователи обратили внимание на фундаментальный эволюционный факт: белки PKA, PKC, ERK и фактор транскрипции CREB не являются уникальными компонентами нервной ткани. Это древнейшие сигнальные пути, которые присутствуют в большинстве эукариотических клеток. Из этого следовала логичная гипотеза. Если инструментарий для формирования памяти есть у обычной клетки тела, возможно, она также способна запоминать ритм внешних воздействий и демонстрировать эффект интервального повторения.

Традиционно принято считать, что «вычисления» в мозге происходят на уровне синапсов и нейронных сетей с огромной скоростью — от миллисекунд до секунд. Однако эти быстрые реакции — лишь часть гораздо более медленных внутриклеточных процессов: передачи сигналов внутри клетки (занимает от секунд до часов) и транскрипции генов (от часов до нескольких дней) — левая колонка. При формировании долговременной памяти фактор транскрипции CREB работает как интегратор. Он собирает данные о кратковременном воздействии от различных сигнальных киназ и запускает более длительный процесс — экспрессию так называемых ранних генов, зависящих от элемента CRE. Именно эти гены физически меняют работу нейрона на долгое время. И хотя сами сигналы на входе и результаты на выходе в этой системе специфичны именно для нервных клеток, сам базовый механизм — превращение короткого импульса в устойчивую, зависимую от CRE работу генов — можно изучать и на обычных, не-нейронных клетках — правая колонка
Автор: Kukushkin, N.V., Carney, R.E., Tabassum, T. et al. Источник: www.nature.com
Конструирование клеточного индикатора

Для проверки этой гипотезы исследователи полностью отказались от работы со сложными культурами нервной ткани. В качестве тестовых моделей они выбрали стандартные линии человеческих клеток, способных к бесконечному делению. В частности, использовались клетки нейробластомы (SH-SY5Y) и обычные клетки эмбриональной почки человека (HEK293).

Инженерам предстояло решить сложную задачу: как визуально зафиксировать момент работы генетической памяти в клетке. Для этого они применили методы генной инженерии, создав стабильный репортерный комплекс. В геном клеток внедрили ген, отвечающий за выработку люциферазы — фермента, который при определенных условиях начинает излучать свет. Этот ген был напрямую подчинен фактору транскрипции CREB. Следовательно, как только клетка начинала процесс запоминания, она должна была светиться.

Но стандартная люцифераза имеет существенный недостаток для подобных экспериментов: она накапливается в клетке. Если фермент остается внутри, ученые не могут определить, работает ли ген прямо сейчас, или они видят остатки прошлой активности. Чтобы решить эту проблему, к гену добавили дестабилизирующую аминокислотную последовательность PEST. Она выполняет функцию сигнала для внутриклеточных систем утилизации: белок необходимо уничтожить сразу после того, как он произведен. Благодаря этому модифицированная люцифераза существует очень короткое время, и уровень свечения клетки в любой момент времени точно отражает текущую, сиюминутную активность генов памяти.

Протокол химического обучения

Поскольку обычные клетки не обладают синапсами и рецепторами для восприятия классических нейромедиаторов (таких как серотонин или дофамин), исследователи использовали химические аналоги. В питательную среду вводились форсколин и форболовый эфир (TPA). Эти вещества способны проникать сквозь клеточную мембрану и напрямую активировать внутриклеточные киназы PKA и PKC, искусственно имитируя мощный процесс обучения.

Эксперимент строился на строгом сравнении двух паттернов стимуляции.

Первой группе клеток назначили режим массированного обучения: на них воздействовали химическими реагентами непрерывно в течение 12 минут. Второй группе предложили режим интервального обучения: те же реагенты подавались четырьмя короткими импульсами по 3 минуты каждый, с перерывами по 10 минут между ними.

Суммарное время активного химического воздействия в обоих случаях было абсолютно идентичным и составляло ровно 12 минут. Разница заключалась исключительно в наличии временных пауз.

A-C Клетки обрабатывали либо комбинацией веществ fsk и TPA (A), либо каждым из них по отдельности (B-C). Схемы (паттерны) воздействия показаны слева. Вещества подавались по трем сценариям: одиночный пульс (1 раз по 3 минуты); «массированное» воздействие (непрерывно 4 раза по 3 минуты без пауз); интервальное воздействие (4 коротких пульса по 3 минуты с паузами (ITI) в 10, 20 или 30 минут). Уровень выработки фермента CRE-luc измерялся спустя 24 часа после начала стимуляции. (N означает количество независимых экспериментов. Звездочки на графиках обозначают уровень статистической значимости различий между массированным и интервальным обучением). D, E Сразу после воздействия TPA по трем разным схемам клетки разрушали для анализа белков методом Вестерн-блоттинга. D — типичные снимки, показывающие уровни общего и активированного (фосфорилированного) белка ERK и CREB сразу после «обучения» (t = 0). E — количественное соотношение активированных P-ERK и P-CREB к общему количеству этих белков. Звездочками показана статистическая значимость. F Иммунофлуоресцентное окрашивание клеток: общий белок ERK показан пурпурным цветом, а активированный P-ERK — зеленым (снимки сделаны сразу после стимуляции). Нижний ряд показывает те же клетки, но после воздействия блокирующего вещества U0126. Ядра клеток выделены синим цветом (маркер DAPI). G Количественная оценка активации ERK (на основе свечения из пункта F). Обработка ингибитором U0126 показывает истинный «нулевой» базовый уровень. H Количественная оценка того, какая часть активированного P-ERK переместилась в ядро клетки по сравнению с остальной цитоплазмой. На графиках показаны медиана, среднее значение и общий разброс данных.
Автор: Kukushkin, N.V., Carney, R.E., Tabassum, T. et al. Источник: www.nature.com
Кривая забывания на уровне ядра

Анализ активности клеток через 4 часа после начала эксперимента показал, что обе группы демонстрируют схожий уровень выработки люциферазы. И массированное, и интервальное воздействие успешно запустили первичную реакцию. Однако настоящая картина формирования долговременной памяти проявилась спустя сутки.

Через 24 часа после завершения стимуляции клетки, подвергшиеся непрерывному воздействию, практически вернулись к базовому состоянию. Их генетическая активность угасла, свечение прекратилось — они забыли полученный сигнал. В резком контрасте с ними, клетки из группы интервального воздействия продолжали демонстрировать устойчивую выработку люциферазы. Уровень транскрипции генов в них был почти в четыре раза выше, чем при непрерывном воздействии.

Более того, изолированные клетки эмбриональной почки продемонстрировали классические свойства кривой забывания Эббингауза: ритмичное распределение сигнала во времени существенно замедлило распад долговременной памяти.

Чтобы окончательно подтвердить, что эффект опирается именно на классические пути памяти, ученые повторили опыт с использованием специфических фармакологических ингибиторов — веществ U0126 и 666-15, которые избирательно блокируют работу белков ERK и CREB соответственно. Применение этих ингибиторов полностью стирало разницу между интервальным и массированным воздействием, подтверждая, что именно эта молекулярная связка отвечает за фиксацию временных интервалов.

Биохимия временных пауз

Почему клетка почки реагирует на паузы? Ответ кроется в кинетике ферментативных реакций.

При массированном, непрерывном химическом сигнале внутриклеточная система быстро достигает предела насыщения. Сигнальные белки фосфорилируются, но их дальнейшая передача в ядро не может происходить бесконечно. Возникает эффект адаптации: клетка перестает реагировать на раздражитель, так как ее рецепторные пути перегружены.

Интервальное воздействие обходит этот барьер. Во время 10-минутных пауз сигнал прерывается. Этого времени достаточно, чтобы активированный белок ERK успел транслоцироваться в ядро клетки, запустить фактор CREB и частично вернуться в исходное состояние. Таким образом, каждый следующий трехминутный импульс падает на уже подготовленную, но не перегруженную систему.

Исследование показало, что такая пульсирующая стимуляция создает петлю положительной обратной связи. Четыре коротких импульса с перерывами не только поддерживают длительную активность существующего белка CREB, но и стимулируют клетку увеличивать общий запас этого белка. Клетка физически адаптирует свой аппарат транскрипции под поступающий ритм.

A Клетки (со встроенным геном luc-CRE) подвергали интервальному (4x) или непрерывному (массированному) воздействию вещества TPA. При этом в питательную среду на 1 или 24 часа добавляли ингибиторы (блокирующие вещества) U0126 или 666-15, чтобы прервать работу белков памяти. Уровень выработки фермента (свечение) измеряли спустя 24 часа после стимуляции. (N — количество независимых экспериментов. Звездочками показана статистическая значимость того, как сильно блокаторы подавили «память» клеток). B Графики показывают соотношение выработки фермента из пункта (A) при интервальном и массированном воздействиях — как с добавлением блокаторов памяти (U0126 или 666-15), так и без них. (Звездочки между столбцами подтверждают статистическую достоверность разницы). C Эксперимент на клетках эмбриональной почки (линия HEK293). В них стабильно внедрили тот же светящийся ген CRE-luc и измерили активность через 24 часа после одиночного (1x), интервального (4x) или непрерывного воздействия TPA. Цель — доказать, что эффект работает не только в нервных клетках. D Клетки HEK293 разрушали сразу после «химического обучения» (по тем же трем схемам, что и в пункте C) для белкового анализа. Графики показывают долю активированных молекул (P-ERK и P-CREB) по отношению к их общему количеству внутри клетки. (Звездочки указывают на уровень статистической значимости. На графиках типа «ящик с усами» отображены все полученные значения точками, а также медиана, среднее арифметическое (знак «+») и общий разброс данных).
Автор: Kukushkin, N.V., Carney, R.E., Tabassum, T. et al. Источник: www.nature.com
Практическое и фундаментальное значение

Выводы этого исследования открывают новые перспективы для двух крупных направлений науки.

Первое направление — фармакология и медицина. Разработка препаратов для лечения когнитивных дефицитов (в том числе болезни Альцгеймера или возрастных нарушений памяти) исторически упиралась в сложность тестирования. Изучение влияния веществ на память требует работы с живыми животными или с хрупкими культурами первичных нейронов. Это делает процесс поиска новых лекарств крайне медленным и дорогостоящим. Открытие того факта, что базовые алгоритмы памяти работают в обычных, быстро делящихся клетках вроде HEK293, позволяет создать бесконечно масштабируемые системы для автоматизированного скрининга. Фармацевтические компании смогут тестировать тысячи соединений на простых клеточных линиях, наблюдая за тем, как они усиливают или ослабляют работу генов памяти.

Второе направление носит фундаментальный характер. Работа команды из Нью-Йоркского университета расширяет рамки концепции когнитивности. Способность извлекать закономерности из окружающей среды, различать временные интервалы и сохранять эту информацию в виде структурных изменений больше не может считаться прерогативой исключительно нервных систем.

Долговременная память базируется на универсальных химических механизмах, которые сформировались в живой природе задолго до появления первого мозга. Сложная нервная система человека не изобретала этот процесс с нуля. Она лишь взяла базовую химическую логику, доступную любой эукариотической клетке, и вывела ее на макроуровень через сеть синапсов. И тот факт, что интервальное обучение работает эффективнее непрерывной зубрежки, продиктован не столько устройством нашего разума, сколько законами ферментативной кинетики, по которым работают клетки всего нашего тела.

Источник: Nature Communications

0 комментариев

Добавить комментарий

Сейчас на главной

Новости

Публикации

В Музее Времени и Часов открылась «секретная» выставка: здесь показывают опытные образцы легендарного НИИ Часпром

Несмотря на то, что фактически НИИ Часпром существует и в наши дни, аббревиатура для многих даже часовых любителей - загадка. Мало кто знает или помнит, что научно исследовали...

Если магнитный щит Земли снова упадет до 5%: как повторение магнитной аномалии Лашамп повысит облучение экипажей самолетов в 75 раз

На высотах от 10 до 12 километров, где пролегают маршруты современных коммерческих авиалайнеров, плотность атмосферы значительно ниже, чем на уровне моря. Из-за этого самолеты и их пассажиры...

Ученые долго не понимали, как тело чувствует холод: ответ нашли в термодинамике нервных рецепторов

Способность живых организмов ощущать температуру окружающей среды — одна из базовых функций нервной системы, особо важная для выживания. У млекопитающих за распознавание холода отвечает...

О чем молчит «собачка»: техническая история символа @

Сегодня символ @ является неотъемлемой частью цифровой жизни, обеспечивая работу электронной почты и социальных сетей. Однако его путь к клавише «2» на клавиатуре занял несколько столетий, пройдя...

Озеро Медуз: единственное место в мире, где медузы дарят эстетичные снимки вместо ожогов

В контексте путешествий и выбора лучшего места для отдыха медузы воспринимаются как вредители и лишний повод убрать точку на карте со своего идеального маршрута. Но есть в мире одно единственное...