Как перераспределение пикселей помогает увеличить разрешение в микроскопии

Пост опубликован в блогах iXBT.com, его автор не имеет отношения к редакции iXBT.com
| Мнение | Оффтопик

Микроскопия — один из самых важных и универсальных методов исследования в науке. С ее помощью можно изучать структуру и функцию живых клеток, тканей и органов, а также наблюдать за динамическими процессами, происходящими в них. Однако микроскопия имеет свои ограничения, связанные с разрешением — способностью различать два близко расположенных объекта. Разрешение зависит от длины волны света, используемого для освещения образца, и от оптической системы микроскопа. Чем короче длина волны, тем выше разрешение, но тем сложнее осветить образец без повреждения его. Кроме того, оптическая система микроскопа не может передать всю информацию о свете, отраженном или испущенном образцом, а только часть его. Это приводит к тому, что изображение становится размытым и потеряны мелкие детали.

Для улучшения качества изображения существуют различные методы, например, деконволюция — математическая операция, которая пытается восстановить исходное изображение из размытого. Однако деконволюция часто усиливает шум — случайные флуктуации интенсивности света, которые мешают видеть реальные объекты. Кроме того, деконволюция требует знания точной формы точечной функции распределения (PSF) — характеристики оптической системы микроскопа, которая определяет, как изображается одна точка в пространстве. PSF может меняться в зависимости от условий эксперимента и сложно ее измерить.

Недавно ученые из Бостонского университета предложили новый алгоритм обработки изображений, который избегает этих проблем и повышает разрешение изображений с сохранением интенсивности фотонов и локальной линейности. Алгоритм был опубликован в журнале Advanced Photonics и доступен как функция MATLAB для широкого использования.

Повышение разрешения с помощью DPR. (a) DPR с коэффициентами усиления 1 и 2, примененными к смоделированным изображениям двух близко расположенных точечных объектов. Слева: два точечных объекта разделены 1,68σ. Правый столбец: два точечных объекта разделены 1,41σ. Масштабная линейка представляет 2σ. (b) Смоделированные результаты провалов интенсивности двух близко расположенных точечных объектов с различными расстояниями между ними в необработанных изображениях, усиление DPR 1 и усиление DPR 2. (c) Усиление DPR 1 и 2, примененное к конфокальным изображениям клеток BPAE. Масштабная линейка представляет 600 нм
Автор: Advanced Photonics (2023). DOI: 10.1117/1.AP.5.6.066004 Источник: phys.org

Основная идея нового алгоритма заключается в перераспределении пикселей. Под пикселем понимается минимальная единица изображения на экране компьютера или камеры. Каждый пиксель имеет определенную интенсивность света и цвет. Перераспределение пикселей заключается в том, что интенсивность каждого пикселя переносится в другое место на изображении в соответствии с локальными градиентами — изменением интенсивности света от одного пикселя к другому. Таким образом, изображение становится более четким, без риска введения артефактов шума. Алгоритм также нормализует исходные изображения перед применением этого процесса, обеспечивая одинаковые результаты.

Разрешение микроскопа традиционно определяется его способностью различать два близко расположенных точечных источника света. Новый метод, названный «размытие с помощью перераспределения пикселей» (DPR), значительно уменьшает необходимое расстояние между ними, позволяя повысить разрешение в микроскопии.

Для демонстрации эффективности DPR ученые применили его к различным условиям изображения: локализации одиночных молекул, структурной визуализации инженерной сердечной ткани и объемной микроскопии зебрафиш. Эти реальные примеры продемонстрировали потенциал DPR в улучшении четкости микроскопических изображений.

Уникальная способность DPR увеличивать четкость изображений, сохраняя при этом большие структуры, открывает двери к более широким применениям. Он может использоваться в ситуациях, когда образцы содержат как маленькие, так и большие структуры, делая его универсальным инструментом для исследователей. Хотя ни один метод размытия не является полностью устойчивым к шуму, преимущество DPR заключается в том, что он не усиливает шум.

Автор: Bing image creator

Новый алгоритм DPR является прорывом в области микроскопии, который позволяет видеть мельчайшие детали живых клеток с высокой четкостью и без потери информации. Это может способствовать новым открытиям в биологии, медицине и других науках.

0 комментариев

Добавить комментарий

Сейчас на главной

Новости

Публикации

Ученые впервые наблюдали процесс, давший начало сложной жизни на Земле: как контакт двух простых клеток изменил ход эволюции

Один из самых сложных вопросов в современной биологии — это механизм появления эукариотической клетки. Вся жизнь на Земле делится на простые микроорганизмы (бактерии и археи) и...

Архитектура преисподней: как на самом деле устроен источник магмы Йеллоустоунского супервулкана

Традиционно считалось, что под Йеллоустоуном находится мантийный плюм. Согласно этой классической концепции, глубоко в недрах планеты, на границе земного ядра и мантии, зарождается мощный...

Секрет Саграда Фамилия: почему у самого высокого храма мира предел высоты в 172 метра

В прошлой статье я писал про долгострой, и вот совпадение, тоже храм, в Таиланде. Но если Храм Истины это самый масштабный проект целиком из древесины, то Саграда Фамилия уже самый высокий...

Как первоцветы выживают в суровых условиях ранней весны

Ранняя весна в центральной полосе России — время, когда природа только пробуждается от зимнего сна. Еще в низинах лежит снег, а на полянках появляются первые цветы, это кажется настоящим...

Где находится самый старый пароход в России и почему его сохранили

На набережной Енисея в центре Красноярска стоит пароход, который по праву считается одним из самых старых сохранившихся судов России. Грузопассажирский колёсный пароход «Святитель Николай»,...