NEC предлагает аппаратный ускоритель обсчёта молекулярных взаимодействий

ПредыдущаяСледующая

Компания NEC сообщила сегодня о доступности для заказа в Японии своего нового сервера Express5800/MD120La(-R), разработанного для ускоренного обсчёта неадгезивных межмолекулярных взаимодействий, вызванных межатомными и электрическими силами. Предназначен он для разработки новых лекарственных препаратов путём моделирования воздействия молекулярной структуры кандидата на роль активного компонента с целевым участком белковой молекулы (рецептором). Как отмечает производитель, разработка основывается большом опыте в производстве микросхем и собственно молекулярном моделировании.

Обсчёт структурных взаимодействий возлагается на специальный аппаратный ускоритель, называемый «MD Engine» (от слов molecular dynamics), который представляет из себя плату расширения и ускоряет примерно в 340 раз обсчёт модели взаимодействия молекулярной системы, содержащей 30 тыс. атомов в программной среде Amber. Собственно, под эту программу, которую производитель считает индустриальным стандартом подобных вычислений, и разрабатывалась плата. Метод просчёта поведения предполагаемого лекарства до начала химических и лабораторных тестов экономит очень много времени и способствует ускорению разработки и внедрения новых лекарств. Сейчас, после расшифровки значительной части генома человека, учёные яснее представляют себе функции белков и их активных участков (рецепторов) в развитии различных заболеваний, что повышает роль математического моделирования ещё больше.

Производитель особо отмечает не только возросшую скорость, но и повышенную точность вычислений, что часто помогает избежать ошибок. Кроме поддержки самой программы Amber возможна поставка к ней дополнительного модуля, позволяющего управлять расчетами с клиентского терминала и визуализировать их результаты, а также содержащего дополнительные библиотеки функций.

Физически система представляет собой рядовой сервер на базе 1-2 процессоров 64-bit Intel Xeon 3,8 ГГц, FSB800 МГц, 2 Мб кэша. Исполнение пьедестальное либо стоечное 2U, 1-4 Гб памяти (DDR 333 или DDR2-400 в рэке), 2-6 дисков SCSI 73,2 Гб, 2 PCI-E 8x + PCI в башенном варианте или 3 PCI-X 64 бит 66 МГц в рэке. Операционная система Red Hat Enterprise Linux AS3 (+ ES3 в рэковом варианте).

Отличает Express5800/MD120La(-R) от других подобных изделий инсталлированная плата MD Engine и ПО Amber разработки Калифорнийского Университета в комплекте. Сервера уже доступны для заказа в Японии, стартовая цена в минимальной конфигурации 3,4 млн. йен. В течение трёх лет NEC планирует реализовать полторы тысячи таких систем. Всемирная сеть сопровождения продукции компании будет осуществлять поддержку пользователей комплектного ПО Amber наравне с поддержкой аппаратной составляющей.

Из аналогов приходят на ум только платы расширения для ускорения просчётов алгоритмов нечёткой логики («нейронные сети»), используемые в частности для прогнозов в финансовой и политической области и, насколько я знаю, до сих пор запрещённых к экспорту в некоторые страны (включая нашу). Так что появятся ли новинки от NEC в нашей стране – пока не ясно.

30 ноября 2005 Г.

12:37

Ctrl
ПредыдущаяСледующая
194
194

Все новости за сегодня

SoftBank стала крупнейшим инвестором Uber, приобретя около 15% акций компании: SoftBank инвестировала в Uber около 9,3 млрд долларов

За накопитель Intel Optane 800P объёмом 120 ГБ придётся отдать больше 300 долларов: SSD Intel Optane 800P получились дорогими40

Квартальная выручка IBM выросла впервые за несколько лет: IBM отчиталась за 2017 год1

Nintendo Labo — уникальный интерактивный конструктор, «оживляющий» картонные творения посредством консоли Switch: Конструктор Nintendo Labo существует в виде трёх наборов31

В некоторых случаях Apple будет менять iPhone 6 Plus на iPhone 6s Plus : У Apple закончились iPhone 6 Plus для замены 29

Ноутбук Xiaomi Mi Notebook Air наконец-то оснастили четырёхъядерными процессорами Intel: Ноутбук Xiaomi Mi Notebook Air получил CPU Intel Kaby Lake Refresh39

Hynix тоже готова отгружать клиентам память GDDR6: У Hynix уже готова память GDDR617

Слабый спрос приведёт к тому, что Apple прекратит производство iPhone X сразу после выхода преемника: Минг-Чи Куо считает, что смартфоны Apple 2018 года будут успешнее текущих78

Опубликованы новые фотографии клона смартфона Samsung Galaxy S9+ : Анонс Galaxy S9 ожидается 26 февраля на MWC 201869

ОС Android 9.0 проходит под кодовым названием Android Pi: Однако часто кодовые названия Android вовсе не совпадали с финальными17

Умная АС Apple HomePod прошла сертификацию FCC и может выйти в любой момент: HomePod будет продаваться по цене 349 долларов30

iXBT TV

  • Обзор цветного светодиодного МФУ Xerox VersaLink C605 для малых и средних офисов

  • Apple отключит замедление iPhone, 10 лет MacBook Air, дрон спас человека

  • Обзор автомобиля Mercedes-Benz E 220 d 4Matic All-Terrain Luxury: полноприводный внедорожный универсал

  • Обзор складной гладильной системы MIE Maxima: утюг, отпариватель для одежды и гладильная доска

  • Обзор недорогого Full HD DLP-проектора BenQ W1050 для домашнего кинотеатра

  • Процессор Intel с графикой AMD, экраны любой формы и размера

  • Критическая уязвимость Intel, разбор Apple iMac Pro, Dell XPS 13 стал тоньше

  • Обзор компактной беспроводной колонки JBL Playlist с поддержкой Chromecast

  • Обзор игрового IPS-монитора LG 34UM69G с соотношением сторон 21:9

  • Обзор блока питания Aerocool P7-750W Platinum с гибридной системой охлаждения

  • Apple специально замедляет старые iPhone, VR-революция, крошечный телефон

  • Обзор широкоугольного объектива Canon EF 35 mm F1.4L II USM

Календарь

ноябрь
Пн
Вт
Ср
Чт
Пт
Сб
Вс