«Черная смерть» была только началом: древняя ДНК показала, как чума возвращалась в Европу четыре века подряд

Новое исследование, опубликованное в журнале PNAS, показало, что «Черная смерть» 1347-1353 годов не была единственной крупной волной пандемии чумы в Европе: после нее бактерияYersinia pestis многократно появлялась в разных регионах, формировала новые генетические линии и распространялась вплоть до начала XVIII века.

Генетики из эстонского Тартуского университета сумели восстановить 26 геномов чумной палочки (Yersinia pestis), извлечённых из останков жертв инфекции. Древнюю ДНК выделили из захоронений на 11 археологических раскопах в пяти странах — Эстонии, России, Великобритании, Швейцарии и Нидерландах. Найденные свидетельства охватывают более трёх столетий европейских вспышек — с середины XIV века (разгар «Чёрной смерти» 1349 года) по 1710 год. Качество сохранности материала различалось: 11 бактериальных геномов удалось прочесть с высокой точностью и полнотой цепочки, а оставшиеся 15 — лишь фрагментарно из-за естественного разрушения биоматериала со временем".

Главной проблемой для специалистов были неточные датировки древних останков. Радиоуглеродный анализ во многих случаях давал интервалы продолжительностью более 100 лет, из-за чего было трудно связать конкретный геном с описанной хронистами вспышкой. Для решения этой задачи ученые разработали метод PhIRM — «филогенетически информированного радиоуглеродного моделирования». Он использует положение генома на эволюционном дереве Y. pestis вместе с радиоуглеродными данными, позволяя сузить временные интервалы. После этого исследователи сопоставили 64 ранее опубликованных и 11 новых геномов и смогли предложить соответствие всем 75 проанализированным геномам с исторически зафиксированными вспышками.

Анализ показал, что возбудитель чумы (Yersinia pestis) проникал на территорию средневековой Эстонии волнами: начиная с исхода XIV века инфекцию сюда завозили неоднократно. На рубеже XV—XVI вв.еков бактерия пережила заметный эволюционный скачок, разделившись на три самостоятельные генетические ветви, которые продолжали циркулировать в регионе еще по меньшей мере сотню лет. Ученые предполагают, что патоген мог не исчезать после эпидемий, а надолго укореняться в местной фауне, образуя скрытые природные очаги среди популяций диких грызунов. Впрочем, гипотеза о том, что эту вспышку разнообразия спровоцировали климатические аномалии — в частности, масштабная Великая засуха эпохи Возрождения, — пока остается лишь вероятным сценарием и требует дальнейших доказательств.

Полученные данные также связывают распространение отдельных линий с военными конфликтами. Генетический анализ показал, что швейцарские образцы ДНК чумной палочки относятся к периоду Тридцатилетней войны, тогда как находки из Таллина связаны с эпидемией 1710 года времен Северной войны — тогда болезнь унесла жизни не только мирных горожан, но и солдат обеих противоборствующих армий, шведской и русской.

Таким образом, после «Черной смерти» чума не исчезла из Европы, но и не представляла собой одну непрерывную эпидемию: генетические данные указывают на серию повторных вспышек, заносов и последующего формирования различных линий бактерии в течение нескольких столетий.

Источник: pnas.org