1 из 7 000 человек обладает встроенной защитой от ожирения: всё дело в редком варианте гена FNIP1

Пост опубликован в блогах iXBT.com, его автор не имеет отношения к редакции iXBT.com
| Статья | Наука и космос

В человеческой биологии заложены базовые механизмы защиты от нарушений обмена веществ. В любой популяции есть люди, чей организм от природы исключительно эффективно перерабатывает питательные вещества. Они сохраняют оптимальный уровень сахара в крови, естественным образом низкий процент жира в печени и гармоничное соотношение мышечной и жировой ткани даже при современном ритме жизни и питании с избытком калорий.

Чтобы понять, какие элементы ДНК обеспечивают такую природную защиту, международный научный консорциум, включающий исследовательский центр Regeneron и ведущие медицинские институты мира, провел масштабную работу. Ученые изучили генетические данные (экзомы) 1 032 116 человек из 11 биобанков Европы, Северной и Южной Америки, а также Южной Азии.

Ген FNIP1 на спирали ДНК, вольная интерпретация
Ген FNIP1 на спирали ДНК, вольная интерпретация
Автор: ИИ Copilot Designer//DALL·E 3 Источник: www.bing.com

Результаты этого масштабного исследования, опубликованные в журнале Nature, открыли биологический путь, который отвечает за эффективный расход энергии. Выяснилось, что редкие природные варианты гена FNIP1 обеспечивают комплексную метаболическую защиту, поддерживая здоровье печени, сердца и сосудистой системы.

Как ученые измерили идеальный энергетический обмен

Для поиска людей с наиболее эффективным метаболизмом исследователи использовали проверенный лабораторный маркер — соотношение триглицеридов к холестерину липопротеинов высокой плотности (индекс TG:HDL).

  • Триглицериды (TG) — это жировые молекулы, плавающие в русле крови. Организм использует их как прямой источник энергии или отправляет в жировую ткань. При идеальном метаболизме клетки быстро окисляют триглицериды, не позволяя им застаиваться в крови или откладываться во внутренних органах.
  • Липопротеины высокой плотности (HDL) — это комплексы из белков и жиров, которые связывают избыточный холестерин и липиды в тканях и сосудах и транспортируют их обратно в печень для переработки.

Низкий показатель TG:HDL говорит о том, что организм легко утилизирует поступающие жиры, сохраняет высокую чувствительность к инсулину и поддерживают правильный состав крови.

Проанализировав миллион участников, ученые обнаружили 59 генов, варианты которых снижают показатель TG:HDL до оптимальных значений. 44 из этих генов ранее никогда не связывались с регуляцией жирового обмена. Однако наиболее выраженные положительные показатели здоровья продемонстрировали люди с редкой мутацией в гене FNIP1.

Как индекс TG:HDL связан с основными показателями организма: a — с общей массой тела и распределением жировой ткани (по данным DEXA, BIA и MRI); b — с уровнем жира в печени (по MRI-PDFF), жира в мышцах (по MRI) и показателями работы печени (по уровням аминотрансфераз); c — с гистологическим состоянием печени: объемом жировых накоплений, активностью MASLD и плотностью ткани (по данным биопсии); d — с ключевыми маркерами обмена веществ: уровнем инсулина натощак (показатель чувствительности к инсулину), гемоглобином A1c (контроль сахара), артериальным давлением и уровнем CRP; e — с долгосрочной вероятностью возникновения T2D, MI, MASLD и цирроза печени. Методология: Анализ показателей проводился на базе данных UKB (уровень инсулина — когорта MDCS, данные биопсии — когорта GHS). Для графиков a–d связи рассчитаны при изменении TG:HDL на 1 s.d. с поправкой на возраст и пол (двустороннее значение P). Для графика e вероятности рассчитаны по модели Кокса (приведены отношения рисков HR и двусторонние значения P).
Как индекс TG:HDL связан с основными показателями организма: a — с общей массой тела и распределением жировой ткани (по данным DEXA, BIA и MRI); b — с уровнем жира в печени (по MRI-PDFF), жира в мышцах (по MRI) и показателями работы печени (по уровням аминотрансфераз); c — с гистологическим состоянием печени: объемом жировых накоплений, активностью MASLD и плотностью ткани (по данным биопсии); d — с ключевыми маркерами обмена веществ: уровнем инсулина натощак (показатель чувствительности к инсулину), гемоглобином A1c (контроль сахара), артериальным давлением и уровнем CRP; e — с долгосрочной вероятностью возникновения T2D, MI, MASLD и цирроза печени. Методология: Анализ показателей проводился на базе данных UKB (уровень инсулина — когорта MDCS, данные биопсии — когорта GHS). Для графиков a-d связи рассчитаны при изменении TG:HDL на 1 s.d. с поправкой на возраст и пол (двустороннее значение P). Для графика e вероятности рассчитаны по модели Кокса (приведены отношения рисков HR и двусторонние значения P).
Автор: Hindy, G., Adam, R.C., Sosina, O. et al. Источник: www.nature.com
Как работает ген FNIP1 в клетках организма

Ген FNIP1 отвечает за выработку белка под названием Folliculin-Interacting Protein 1.

В обычных условиях белок FNIP1 соединяется с другим белком — фолликулином (ген FLCN). Вместе они контролируют поведение двух важных белковых факторов — TFEB и TFE3. Эти факторы находятся внутри клеток и отвечают за включение генов, формирующих две ключевые системы энергетического обмена:

  1. Митохондрии — внутриклеточные структуры, которые сжигают жирные кислоты и глюкозу, вырабатывая энергию для жизнедеятельности клетки.
  2. Лизосомы — внутриклеточные структуры, расщепляющие сложные жировые соединения на простые компоненты.

Когда ген FNIP1 работает в полном объеме, создаваемый им белковый комплекс удерживает факторы TFEB и TFE3 вне ядра клетки. В результате клетка производит умеренное количество новых митохондрий и сохраняет поступившие жиры про запас.

Когда же функция гена FNIP1 снижена из-за редкого природного варианта, белковый комплекс не формируется. Факторы TFEB и TFE3 свободно проникают в ядро клетки и активируют работу генов, контролирующих энергетический обмен. В клетке происходят следующие процессы:

  • Формируется больше активных митохондрий, способных быстро перерабатывать жиры.
  • Усиливается выработка ферментов, расщепляющих липидные капли внутри лизосом.
  • Клетка начинает активно поглощать жирные кислоты из крови и перерабатывать их в энергию, поддерживая чистоту тканей.
Здоровье людей с редким вариантом гена FNIP1

Природные варианты гена FNIP1 с пониженной функцией встречаются примерно у 0,01% населения (у одного человека из 7000). Ученые подробно изучили показатели здоровья у гетерозиготных носителей — людей, у которых от рождения изменена одна из двух копий этого гена.

Анализ медицинских данных показал, что такие люди обладают комплексным метаболическим преимуществом:

  1. Естественно низкий уровень жира в печени: по данным магнитно-резонансной томографии (МРТ), у носителей варианта гена FNIP1 в печени содержится минимальное количество жировых отложений.
  2. Здоровый уровень сахара в крови: у этих людей зафиксированы оптимальные показатели глюкозы и длительного сахара в крови (гликированного гемоглобина HbA1c), что указывает на высокую чувствительность тканей к инсулину.
  3. Благоприятный состав тела: носители гена обладают меньшим процентом висцерального жира (жировой ткани вокруг внутренних органов) и естественно более высоким процентом мышечной массы.
  4. Защита печени: уровень печеночных ферментов (АЛТ) в крови снижен, что свидетельствует об отсутствии воспалительных процессов и высоком здоровье клеток печени.
  5. Долгосрочная защита сердечно-сосудистой системы: вероятность возникновения метаболических осложнений со стороны сердца, сосудов, печени и поджелудочной железы у людей с этим вариантом гена ниже более чем на 60%.

Ученые также подтвердили абсолютную безопасность этого состояния. Хотя полная отмена работы обеих копий гена FNIP1 (гомозиготное состояние) является редким заболеванием, гетерозиготные носители с одной измененной копией абсолютно здоровы. Их иммунная система работает идеально, но при этом организм получает полную метаболическую защиту.

Результаты генетического анализа и активность генов в тканях организма: a — Связь генов по всему экзому с показателем TG:HDL. Треугольники указывают на связь с повышением (направлены вверх) или со снижением (направлены вниз) показателя TG:HDL. Значения P для каждого гена рассчитаны методом ACAT на основе 24 моделей анализа (двусторонний тест Вальда). b — Соотношение между частотой аллелей (AAF) и силой их влияния (показатель β) для 1 617 частых генетических вариантов (серые точки) и 60 генотипов с редкими мутациями (коралловые точки), связанных с TG:HDL. Размер точек пропорционален силе эффекта. Значения β приведены для наиболее точных моделей с наименьшим значением P. c — Активность 59 выявленных генов в различных тканях организма по сравнению со всеми остальными генами. Показатель OR отражает вероятность того, что ген связан с TG:HDL (при P не более 1.04 × 10⁻⁷) именно за счет его высокой активности в конкретной ткани. Повышенной считалась активность минимум на 6 s.d. выше среднего уровня по тканям. Синяя пунктирная линия обозначает порог значимости (P = 0.0011 с поправкой Бонферрони для 43 тканей). На графике показаны топ-20 тканей (расчеты выполнены по логистической модели с поправкой Фёрса). d — Распределение 59 выявленных генов по тканям организма, в которых они проявляют наибольшую активность (по базе данных GTEx).
Результаты генетического анализа и активность генов в тканях организма: a — Связь генов по всему экзому с показателем TG:HDL. Треугольники указывают на связь с повышением (направлены вверх) или со снижением (направлены вниз) показателя TG:HDL. Значения P для каждого гена рассчитаны методом ACAT на основе 24 моделей анализа (двусторонний тест Вальда). b — Соотношение между частотой аллелей (AAF) и силой их влияния (показатель β) для 1 617 частых генетических вариантов (серые точки) и 60 генотипов с редкими мутациями (коралловые точки), связанных с TG:HDL. Размер точек пропорционален силе эффекта. Значения β приведены для наиболее точных моделей с наименьшим значением P. c — Активность 59 выявленных генов в различных тканях организма по сравнению со всеми остальными генами. Показатель OR отражает вероятность того, что ген связан с TG:HDL (при P не более 1.04 x 10⁻⁷) именно за счет его высокой активности в конкретной ткани. Повышенной считалась активность минимум на 6 s.d. выше среднего уровня по тканям. Синяя пунктирная линия обозначает порог значимости (P = 0.0011 с поправкой Бонферрони для 43 тканей). На графике показаны топ-20 тканей (расчеты выполнены по логистической модели с поправкой Фёрса). d — Распределение 59 выявленных генов по тканям организма, в которых они проявляют наибольшую активность (по базе данных GTEx).
Автор: Hindy, G., Adam, R.C., Sosina, O. et al. Источник: www.nature.com
Экспериментальное подтверждение: точечная помощь печени

Чтобы выяснить, можно ли воспроизвести эти благоприятные эффекты у других людей, ученые провели серию лабораторных исследований. Смысл заключался в том, чтобы снизить активность гена FNIP1 не во всем теле, а строго в клетках печени (гепатоцитах), которые отвечают за основной объем жирового обмена.

Исследование на человеческих клетках

В лабораторных условиях ученые снизили активность гена FNIP1 в первичных клетках печени человека с помощью метода РНК-интерференции (используя короткие молекулы РНК, уничтожающие копии мРНК гена).

В ответ на снижение уровня белка FNIP1 клетки печени мгновенно увеличили экспрессию генов, ответственных за расщепление жиров и очищение клеток от липидных накоплений. Это доказало, что механизм работает в человеческой ткани напрямую.

Исследование на моделях животных

Затем ученые провели опыт на мышах, содержавшихся на диете с высоким содержанием жиров и фруктозы. С помощью безопасных вирусов-доставщиков (AAV8) активность генов Fnip1 и Fnip2 снизили исключительно в клетках печени.

Результаты показали:

  • Мыши с пониженной активностью генов в печени сохраняли нормальный вес и не набирали жировую массу даже при избыточном калорийном питании.
  • В их печени не накапливались жировые отложения, а показатели ферментов АЛТ оставались на уровне здоровой нормы.
  • Животные сохраняли высокую чувствительность к инсулину и нормальный уровень сахара в крови.
Генетический анализ гена HPN у человека и результаты его подавления у мышей: a — Соотношение между уровнем активности гена HPN в печени и показателем TG:HDL в области этого гена. Показана степень сцепления (показатель r²) с ключевым генетическим вариантом rs45512696. b — Уровень активности гена HPN в ткани печени в зависимости от генотипа rs45512696. На графиках показаны медиана (центральная линия), 25-й и 75-й процентили (границы прямоугольников) и крайние значения данных. TMM — усеченное среднее M-значений. c — Связь редких вариантов pLOF (при AAF менее 1%), вариантов pLOF в сочетании с точечными мутациями (по прогнозам ESM1vp или пяти алгоритмов, при AAF менее 0.1%), а также частого варианта rs45512696 с уровнем липидов и альбумина в крови (показатель β ± 95% CI). Оценки получены методом метаанализа, значения P рассчитаны с помощью двустороннего теста Вальда. d — Уровень мРНК гена Hpn в печени у мышей дикого типа (WT) на обыкновенном рационе при введении AAV8-Hpn shRNA, контрольной shRNA или физраствора (PBS). Данные представлены как среднее ± s.e.m. (n = 10 мышей в группе). Значения P рассчитаны с помощью однофакторного теста ANOVA с поправкой Тьюки. e–h — Уровень липидов в крови у мышей WT до (неделя 0) и через 6 недель после введения препаратов. Подавление гена Hpn приводит к естественному снижению уровней non HDL-C (e), HDL-C (f), LDL-C (g) и триглицеридов (h). i — Уровень альбумина в крови у мышей WT до и через 6 недель после введения препаратов. Для всех измерений плазмы (e–i) данные представлены как среднее ± s.e.m. (n = 10 мышей в группе). Значения P рассчитаны методом двухфакторного теста ANOVA с поправкой Тьюки. Для пунктов d–i приведены точные значения P. ESM1vp — моделирование на основе эволюционной шкалы.
Генетический анализ гена HPN у человека и результаты его подавления у мышей: a — Соотношение между уровнем активности гена HPN в печени и показателем TG:HDL в области этого гена. Показана степень сцепления (показатель r²) с ключевым генетическим вариантом rs45512696. b — Уровень активности гена HPN в ткани печени в зависимости от генотипа rs45512696. На графиках показаны медиана (центральная линия), 25-й и 75-й процентили (границы прямоугольников) и крайние значения данных. TMM — усеченное среднее M-значений. c — Связь редких вариантов pLOF (при AAF менее 1%), вариантов pLOF в сочетании с точечными мутациями (по прогнозам ESM1vp или пяти алгоритмов, при AAF менее 0.1%), а также частого варианта rs45512696 с уровнем липидов и альбумина в крови (показатель β +- 95% CI). Оценки получены методом метаанализа, значения P рассчитаны с помощью двустороннего теста Вальда. d — Уровень мРНК гена Hpn в печени у мышей дикого типа (WT) на обыкновенном рационе при введении AAV8-Hpn shRNA, контрольной shRNA или физраствора (PBS). Данные представлены как среднее +- s.e.m. (n = 10 мышей в группе). Значения P рассчитаны с помощью однофакторного теста ANOVA с поправкой Тьюки. e-h — Уровень липидов в крови у мышей WT до (неделя 0) и через 6 недель после введения препаратов. Подавление гена Hpn приводит к естественному снижению уровней non HDL-C (e), HDL-C (f), LDL-C (g) и триглицеридов (h). i — Уровень альбумина в крови у мышей WT до и через 6 недель после введения препаратов. Для всех измерений плазмы (e-i) данные представлены как среднее +- s.e.m. (n = 10 мышей в группе). Значения P рассчитаны методом двухфакторного теста ANOVA с поправкой Тьюки. Для пунктов d-i приведены точные значения P. ESM1vp — моделирование на основе эволюционной шкалы.
Автор: Hindy, G., Adam, R.C., Sosina, O. et al. Источник: www.nature.com
Как печень передает сигнал о здоровье всему организму

В ходе экспериментов ученые установили интересную закономерность: избирательное снижение активности гена FNIP1 происходило только в печени, но жировые отложения снижались по всему телу, включая подкожный жир.

Исследователи выяснили, как печень связывается с жировой тканью:

Снижение функции гена FNIP1 в печени снижает выработку гена Inhbe более чем на 50%. Этот ген отвечает за производство сигнального белка — Активина E.

В обычных условиях печень выделяет Активин E в кровь, чтобы дать сигнал жировым клеткам сохранять запасы и не расщеплять жир. Когда выработка Активина E в печени снижается, жировые клетки по всему телу освобождаются от этого воздействия. Они активируют внутренние митохондрии, запускают процесс естественного расщепления жира и поддерживают здоровый уровень энергии в организме.

Другие защитные гены и будущее медицины

Помимо гена FNIP1, анализ данных миллиона человек помог открыть и другие гены, обеспечивающие природную защиту обмена веществ. Ученые выделили ген HPN (гепсин).

Выяснилось, что редкие варианты гена HPN, снижающие его активность в печени, приводят к естественному падению уровня триглицеридов и «плохого» холестерина (липопротеинов низкой плотности, LDL) в крови. Эксперименты подтвердили, что точечное снижение активности гепсина помогает поддерживать идеальный состав крови без изменений веса или общего состояния организма.

Новый этап развития медицины

Анализ данных миллиона человек показал: природе уже известны механизмы, позволяющие сохранять здоровье печени, сосудов и оптимальный вес.

Чтобы передать эти преимущества людям, не обладающим редким вариантом гена от рождения, ученым не требуется изменять ДНК. Сегодня разрабатываются терапевтические РНК-препараты на основе технологии GalNAc-siRNA. Молекула GalNAc служит точным транспортным средством, которое доставляет РНК-препарат строго в клетки печени, не затрагивая другие органы.

Подобные препараты вводятся всего один или два раза в год. Они временно снижают выработку белка FNIP1 в печени, воссоздавая естественные защитные процессы.

Воспроизведение природного механизма защиты позволит поддерживать правильный уровень сахара, оптимальный вес и здоровье печени у любого человека, помогая сохранять качество жизни на долгие годы.

Источник: Nature

1 комментарий

ZatroilSleganca
Фух, я увернулся от этого гена FNIP1

Добавить комментарий

Сейчас на главной

Новости

Публикации

Можно ли спастись от бегемота, забравшись на дерево: почему знаменитый совет может оставить человека без выхода

Со стороны бегемот совсем не похож на животное, рядом с которым понадобится дерево. Короткие ноги, округлое тяжёлое тело, почти ленивые движения в воде. Кажется, что при необходимости достаточно...

Чихуахуа оказались отчасти койотами — и это наконец объясняет их дерзкий и бесстрашный характер

Маленький размер, вес менее трех килограммов, дрожь в теле и привычка сидеть в дорожной сумке создали породе чихуахуа репутацию хрупкого декоративного аксессуара. Однако любой кинолог, ветеринар...

С какой скоростью на самом деле растут горы: древний супервулкан дал геологам точный ответ

Определение скорости роста горных хребтов — одна из самых сложных прикладных задач физической геологии. Земная кора непрерывно деформируется под действием тектонических сил, однако...

Как гиена разгрызает кости, которые не поддаются льву: в чём секрет её челюстей?

Когда лев завершает трапезу, на земле остаются фрагменты скелета, которые для большинства хищников представляют лишь несъедобный остаток. Бедренная кость антилопы гну или ребро зебры не поддаются...

Механическая клавиатура, которая отлично подружилась с MacBook Neo: обзор VAIVER Leaf V3

Механических клавиатур сейчас огромное количество, и на бумаге многие из них выглядят практически одинаково: переключатели, несколько вариантов подключения, подсветка, компактный корпус. Но когда...

Зачем раньше в деревнях на заборы вешали глиняные горшки и бутылки

В любом деревенском пейзаже раньше да и иногда и сегодня можно было увидеть стеклянные бутылки или банки, насаженные на колья изгороди, и глиняные крынки, висящие на плетне. Но для чего же...