NEC предлагает аппаратный ускоритель обсчёта молекулярных взаимодействий

1174

Компания NEC сообщила сегодня о доступности для заказа в Японии своего нового сервера Express5800/MD120La(-R), разработанного для ускоренного обсчёта неадгезивных межмолекулярных взаимодействий, вызванных межатомными и электрическими силами. Предназначен он для разработки новых лекарственных препаратов путём моделирования воздействия молекулярной структуры кандидата на роль активного компонента с целевым участком белковой молекулы (рецептором). Как отмечает производитель, разработка основывается большом опыте в производстве микросхем и собственно молекулярном моделировании.

Обсчёт структурных взаимодействий возлагается на специальный аппаратный ускоритель, называемый «MD Engine» (от слов molecular dynamics), который представляет из себя плату расширения и ускоряет примерно в 340 раз обсчёт модели взаимодействия молекулярной системы, содержащей 30 тыс. атомов в программной среде Amber. Собственно, под эту программу, которую производитель считает индустриальным стандартом подобных вычислений, и разрабатывалась плата. Метод просчёта поведения предполагаемого лекарства до начала химических и лабораторных тестов экономит очень много времени и способствует ускорению разработки и внедрения новых лекарств. Сейчас, после расшифровки значительной части генома человека, учёные яснее представляют себе функции белков и их активных участков (рецепторов) в развитии различных заболеваний, что повышает роль математического моделирования ещё больше.

Производитель особо отмечает не только возросшую скорость, но и повышенную точность вычислений, что часто помогает избежать ошибок. Кроме поддержки самой программы Amber возможна поставка к ней дополнительного модуля, позволяющего управлять расчетами с клиентского терминала и визуализировать их результаты, а также содержащего дополнительные библиотеки функций.

Физически система представляет собой рядовой сервер на базе 1-2 процессоров 64-bit Intel Xeon 3,8 ГГц, FSB800 МГц, 2 Мб кэша. Исполнение пьедестальное либо стоечное 2U, 1-4 Гб памяти (DDR 333 или DDR2-400 в рэке), 2-6 дисков SCSI 73,2 Гб, 2 PCI-E 8x + PCI в башенном варианте или 3 PCI-X 64 бит 66 МГц в рэке. Операционная система Red Hat Enterprise Linux AS3 (+ ES3 в рэковом варианте).

Отличает Express5800/MD120La(-R) от других подобных изделий инсталлированная плата MD Engine и ПО Amber разработки Калифорнийского Университета в комплекте. Сервера уже доступны для заказа в Японии, стартовая цена в минимальной конфигурации 3,4 млн. йен. В течение трёх лет NEC планирует реализовать полторы тысячи таких систем. Всемирная сеть сопровождения продукции компании будет осуществлять поддержку пользователей комплектного ПО Amber наравне с поддержкой аппаратной составляющей.

Из аналогов приходят на ум только платы расширения для ускорения просчётов алгоритмов нечёткой логики («нейронные сети»), используемые в частности для прогнозов в финансовой и политической области и, насколько я знаю, до сих пор запрещённых к экспорту в некоторые страны (включая нашу). Так что появятся ли новинки от NEC в нашей стране – пока не ясно.

30 ноября 2005 Г.

12:37

Ctrl
ПредыдущаяСледующая

Все новости за сегодня

Samsung откроет шоурум в футуристическом торговом центре Лондона: Samsung займёт верхний этаж ТЦ Coal Drops Yard своим демонстрационным центром26

Qualcomm и Mercedes-AMG Petronas Motorsport расширили стратегическое сотрудничество: Они будут вместе разрабатывать высокоскоростную связь и беспроводное питание для гоночных машин2

Razer оценила web-камеру Kiyo и микрофон Seiren X в 100 долларов за каждую новинку: Razer представила web-камеру Kiyo и микрофон Seiren 3

FAA предлагает запретить провоз камер и других электронных устройств в багаже: Международная организация гражданской авиации (ICAO) планирует обсудить предложение FAA в ближайшее время28

Смартфон Huawei Mate 10 Pro в рейтинге DxOMark обошёл Samsung Galaxy Note 8 и Apple iPhone 8 Plus: Смартфон Huawei Mate 10 Pro в рейтинге DxOMark заработал 97 баллов55

Amazon и eBay обвинили в попустительстве мошенничеству с НДС: По оценке налогового департамента, только в прошлом и позапрошлом году недополучено 1-1,5 млрд фунтов стерлингов13

Еще одна версия Xiaomi Mi Notebook Air 13 по характеристикам оказалась хуже предыдущей : 47

Камера Detu F4 Plus снимает сферические панорамы с разрешением 8К: Камера F4 Plus позиционируется как профессиональное решение и стоит $25994

Смартфон HTC U11 Plus получит степень защиты IP68, Edge Sense и Boom Sound, но не будет представлен 2 ноября : ЖК-дисплей устройства будет иметь диагональ 6 дюймов при разрешении WQHD+ и плотности пикселей 538dpi10

Samsung Artik s — защищенные беспроводные вычислительные модули для IoT: Платформа Samsung Artik IoT будет полностью интегрирована с платформой SmartThings Cloud

Уже выпущенные телевизоры LG получат поддержку звука в формате Dolby TrueHD: Прошивка будет выпущена до конца месяца10

Опубликованы новые изображения смартфона Meizu X2, который оснащен дополнительным круглым дисплеем: Meizu X2 должен выйти в линейке Blue Charm и относиться к среднему ценовому сегменту11

Платформа для оперативной доставки и распределения финансовой информации nxFeed FPB2 построена на FPGA Xilinx Virtex UltraScale+: Платформа nxFeed FPB2 превосходит решения предыдущего поколения по производительности на 30%

Dodocool предлагает кабель для зарядки iPhone и iPad в форме брелока для ключей: 9

В базе TENAA замечен загадочный смартфон HTC с дактилоскопическим датчиком на задней панели: Основой HTC 2Q4D200 служит SoC с восьмиядерным процессором

В семействе АС Google Home появится модель Quartz с экраном: Напомним, дисплеями оснащены такие умные АС, как Amazon Echo и Echo Spot1

Умная акустическая система 808 Audio XL-V обеспечивает доступ к голосовому помощнику Amazon Alexa : Умная акустическая система 808 Audio XL-V стоит $130

По статистике Chrome, доля защищенного трафика на платформе Android за год выросла с 42% до 64%: Переход на HTTPS продолжается4

Опубликованы изображения 3D-карт Asus GeForce GTX 1070 Ti Turbo и ROG Strix GTX 1070 Ti Gaming: Сведений о частотах компонентов 3D-карт Asus GeForce GTX 1070 Ti Turbo и ROG Strix GTX 1070 Ti Gaming пока нет

997
1318

iXBT TV

  • Обзор беззеркальной фотокамеры Fujifilm X-A3 формата APS-C со сменными объективами

  • Обзор беззеркальной фотокамеры Fujifilm X-A10 формата APS-C со сменными объективами

  • Планшеты для подводного чтения, дешевый безрамочный смартфон и автономная VR-гарнитура

  • Обзор 3D-принтера Funtastique Evo: дешевая, но вполне функциональная DIY-модель

  • Обзор робота-пылесоса Polaris PVCR 0920WV Rufer с функцией влажной протирки полов

  • Новинки Google на любой вкус: Pixel 2, Pixel 2 XL, Pixelbook, Clip, Home Mini и Max

  • Обзор водонепроницаемого бинокля Canon 10x42L IS WP с оптическим стабилизатором

  • Обзор компактного вертикального пылесоса Kitfort КТ-525

  • Обзор 15-дюймового игрового ноутбука MSI GE63VR 7RF Raider 4K с 4K-экраном

  • Ракета вместо самолета, умные AC Amazon, робот-мяч

  • Обзор парогенератора MIE Stiro Pro для глажки, отпаривания и уборки дома

  • Обзор изогнутого 37,5-дюймового IPS-монитора Acer XR382CQK с соотношением сторон 21:9

1212

Календарь

ноябрь
Пн
Вт
Ср
Чт
Пт
Сб
Вс

Рекомендуем почитать